Zaključana nukleinska kiselina, LNA

Zaključane nukleinske kiseline (LNA) su klasa derivata nukleotida sa jedinstvenom bicikličnom strukturom. Njihova molekularna strukturna karakteristika leži u formiranju krutog bicikličkog sistema preko metilenskog mosta između 2'-atoma kisika i 4'-atoma ugljika riboznog prstena. Ova strukturna modifikacija daje LNA fizikalno-hemijskim svojstvima koja se jasno razlikuju od onih konvencionalnih DNK i RNK. Iz perspektive molekularne dinamike, uvođenje metilenskog mosta zaključava inherentno visoko fleksibilan furanozni ribozni prsten u fiksnu konformaciju, značajno smanjujući unutarmolekularnu slobodu rotacije. Ova strukturna karakteristika direktno dovodi do tri ključna efekta:

Prvo, fiksirana konformacija šećernog prstena značajno povećava lokalnu rigidnost fosfatne kičme, što daje LNA oligonukleotidima odličnu otpornost na nukleaze.

Drugo, konformacijsko zaključavanje omogućava nukleobazama da održe optimalnu Watson-Crick geometriju uparivanja, značajno povećavajući hibridizacijski afinitet. Studije su pokazale da jedna LNA modifikacija može povećati temperaturu topljenja (Tm) oligonukleotidnog dupleksa za 2-8 stepeni, a ovo poboljšanje termičke stabilnosti je posebno izraženo u kratkolančanim aplikacijama oligonukleotida{4}}.

Konačno, kruta struktura također daje višu specifičnost sekvence LNA molekulima, omogućavajući im da razlikuju jedno-podudaranje baze s većom preciznošću.

npr. sljedeći proizvodi:

CAS br.: 206055-79-0 LNA-A(Bz) fosforamidit

CAS broj: 206055-82-5 LNA-5mC(Bz) fosforamidit

CAS br.: 206055-75-6 LNA-T fosforamidit

CAS br.:206055-77-8 LNA-G(iBu)-CE-fosforamidit

CAS br.:709641-79-2 LNA-G(DMF)-fosforamidit